Храм во имя святителя Николая, записанный в описи 1626 года как "церковь Никола Чудотворец в городе же", первоначально стоял на городской площади в крепости. В Козью слободку, на нынешнее место, перенесен в 1775 - 1779 годах на общественные пожертвования и построен каменным.
Первоначально храм был небольшим однопрестольным. В 1844 году к нему была пристроена трапезная часть с двумя приделами - в честь Тихвинской иконы Божией Матери и святителей Московских Петра, Алексия, Ионы, Филиппа и Ермогена, а также колокольня, которая стала доминантой всего ансамбля. Выдержанная в традициях древнерусского зодчества, она хорошо сочетается с древним храмом. Три яруса увенчаны сверху мощной шлемообразной главой, сияющей червонным золотом.